发起总攻，江南大营被击溃
正当江南大营受到冲击的时候，太平军各路主力已经云集天京东北郊，杨秀清决定抓住有利战机，彻底摧毁江南大营。面对太平军的强大攻势，向荣只得从外围各据点收缩兵力，增防江南大营。
向荣的江南大营主营驻扎于钟山的南侧，与天京城相隔2.5千米，距孝陵卫有1.5千米。17日太平军开始进攻，19日天还没亮，石达开、秦日纲派军四五千人攻仙鹤门等营盘。稍后又添兵数千，一直激战到夜晚才收队。张国樑军回到孝陵卫后连夜筑营，企图堵住太平军向西进攻的通路。
6月20日清晨，太平军发起总攻。主力进攻青马群，一部出太平门直指江南大营西翼(应在今廖仲恺墓附近)，一部翻越钟山从江南大营后路进攻。此时，城内的太平军也从通济门、朝阳门(今中山门)出击，威胁大营左翼营区。石达开等率大军分十多路猛攻青马群。向荣派兵五百人往援。东王又派军数千从通济门出城，直攻七桥瓮张国樑营。
向荣急了，亲自率领1200人去救张国樑。午后，秦日纲派兵四五千人翻钟山从灵谷寺围攻清军马队营盘。同时，东王派兵从正阳、朝阳等门出击，将江南大营从紫金山南至七桥瓮的20余个营垒一齐攻破。接着秦日纲等率领占绝对优势的太平军围攻孝陵卫主营，击溃了向荣全军。清军大将张国樑负伤逃走。
这样困扰天京三年多的江南大营就被击溃了。向荣败退丹阳后，愧愤交加，老病交侵，8月9日死于丹阳军营 。
二破江北大营
陈李大军进攻浦口，清军损失万余人
一破江南江北大营的胜利之时，太平天国内部的危机却凸显了出来，天京事变中，东王杨秀清、北王韦昌辉及燕王秦日纲在领导层的内讧中被杀，一破江南江北大营的大好局面丧失殆尽。而江南大营进入了和春任主帅的时代，清军借机发起进攻，但因为太平军的城防工事，清军水、陆进攻都没有得手。
1857年5月，石达开出走。清军利用太平天国内部新的分裂，集中兵力在天京外围攻城拔寨。到12月，溧水、句容失守、镇江失守。
1858年，天王洪秀全重新提拔了一批年轻将领到领导岗位上来，重建了前期的五军主将制度。封陈玉成为前军主将，李秀成为后军主将，李世贤为左军主将，韦俊为右军主将，蒙得恩为中军主将兼正掌率。至此，太平天国后期新的领导中枢建立起来了，后天王又封族弟洪仁玕为军师和干王。
1858年8月，陈玉成、韦俊部首先动作，从安徽潜山前出舒城建立了前进基地。李世贤兵团矛头直指庐州。李秀成也同时行动，主力集结滁州，向江北大营展开牵制性进攻。8月23日，庐州府被攻克。陈玉成立即着手实施第二阶段行动计划——与李秀成会师，击溃江北大营。
江北大营的主帅德兴阿(1854年琦善因病死于扬州军中，德兴阿继任主帅)已从太平军降将处得到情报，紧张备战。江北大营是天京战区清军的薄弱部分，兵力不足、战斗力差。
9月17日，陈玉成兵团以号称20万人的大军从滁州进抵乌衣、水口一线，与李秀成兵团在乌衣胜利会师后，斗志十分旺盛。9月27日，陈、李大军大举进攻浦口，江北大营土崩瓦解。粮台军资，皆被缴获，清军损失万余人。这是天京事变以后最大的一次胜利，结束了太平天国战略退却的被动局面。
再破江南大营
太平军设空城计，再杀了一个回马枪
江北大营的攻破虽然打通了天京与江北的联系，但天京之围的形势还是日益严峻。为此，洪秀全等多次讨论解救京围的方案。先向长江下游进攻，得苏杭和上海后，再沿长江向上游水陆并进，攻取湖北。
浙江军情警报不断送到江南大营，果然不出李秀成等人所料，主帅和春立即派兵救援。江南大营先后调拨兵勇援浙不下1.3万人，大营逐渐清空。
1860年3月19日清晨，太平军通过挖掘地道爆破轰塌了杭州清波门城墙，李秀成率军攻入城内。3月22日，江南大营的援军来到杭州城外。李秀成在城内插满旗帜，并于24日夜间，偷偷撤出全部太平军。清军中了李秀成布下的空城计。
李秀成部从杭州杀了一个回马枪，沿天目山小路取捷径直奔天京，途中与李世贤部会师，兵分五路进军天京。至1860年4月底，太平军五路大军集结天京城外，总兵力约10万余人。4月27日，开始对江南大营发起总攻，内外夹击江南大营。张国樑率部连日拼杀，但南路李秀成、东北路李世贤、西路陈玉成、南路杨辅清等部还是攻破了孝陵卫清军各营。
江南大营被攻破后，和春与张国樑不得不退守镇江，不得立足又退守丹阳。当张国樑听说冯子材在镇江未败，立刻率兵出城寻找冯子材的军队来援救。不料在城外遇到了太平军，清兵一触即溃。张国樑在策马渡河中溺死。 而和春逃到常州，中弹负伤。5月26日，在浒墅关(在今苏州吴县境内)因绝望而上吊自杀，清军经制兵对天京的围攻彻底失败。
战事背后
拉锯战
为何打了八年？
清军经制兵与太平军围绕天京的攻与防前后一共8年时间，这一系列攻防战役都反映了清王朝和太平天国的种种问题。
在向荣时期，由于清廷关注的重心在阻击太平军北伐的北方战区，江南江北大营的地位并不高。向荣战役战术实践经验丰富，但对整个战争大局缺乏统筹考虑，他对1856年太平军的大反攻没有丝毫的预见，最后全线败退。
就太平军来说，从1853年定都南京开始就在战略部署上出现了错误，过分相信自己从广西打到南京的经验和能力。北伐和西征不顾分兵大忌，以至于江南江北大营在天京周边坐大，再也没有能力去清除首都周边的清军力量，直到1855年底和1856年的危机出现。最后不得不调集其他战场上的重兵集团去解决这一问题，影响了西部战场上的优势局面。而一破江南江北大营的胜利，又加剧了杨秀清功高盖主的危险，在天京城内出现了大规模的内讧。这也是太平天国最让人感慨万千和令人叹息的一段历史。
二破江南江北大营可以说是洪仁玕、李秀成、陈玉成等新的领导中枢的得意之笔，也掀起了太平天国战争的第二个高潮。和春等人不仅没有向荣的实战经验，自身也不愿深入战场，庸碌无为，更是缺乏应有的谋略。和春对太平军围魏救赵的计策没有丝毫防备，中了太平军调虎离山之计。当太平军兵临城下之时，无可奈何，只好仓皇而逃。江南江北大营的再次被破，反映了琦善、德兴阿、和春等满清贵族们所统率的八旗和绿营经制兵不断被削弱，战斗力渐失。
八旗和绿营经制兵的失败成就了曾国藩。在二破江南大营后，清廷转而依靠于曾国藩的湘军集团，最终平定太平天国。当然，这是后话。